Erster Newsletter zu Genanalysen

Die Parosphromenusgruppe (siehe unter "Prachtguramis") hat bereits vor einem halben Jahr Kontakt zu der internationalen "Barcode-of-Life"-Initiative aufgenommen, die ein weltweit organisiertes Forschungsprojekt zur genetischen Sequenzierung von Pflanzen und Tieren ins Leben gerufen hat. Dabei spielen auch die Fische und hierbei die Layrinther eine bedeutende Rolle. Ich habe darüber kurz auf der IGL-Tagung in Ruhmannsfelden im Plenum berichtet.

Unser Partner, Dipl.-Biol. Dirk Steinke von der Uni Konstanz, die in Mitteleuropa die Federführung des BoL-Projekts für Fische übernommen hat, hat nun im Dezember 2005 den ersten Newsletter zu Genanalysen von Prachtguramis und einigen anderen Labyrinthfischen fertiggestellt. Da es uns bei der Zusammenarbeit insbesondere um die schwer zu bestimmenden Prachtguramis geht, wurde er bereits an alle Mitglieder der Parosphromenusgruppe versandt und in den Prachtguramiteil dieser IGL-Homepage eingestellt; er soll hier aber in Auszügen auch allen Interessierten zugänglich gemacht werden. (Bitte bei Antworten oder Reaktionen auf die Paroseiten gehen und diese dort einstellen!)

Aufgrund des großen Interesses an unserer Arbeit an DNA Barcodes der Labyrinthfische haben wir uns entschlossen, diesen Newsletter von Zeit zu Zeit an die Mitglieder der IGL zu verteilen. Er soll in unregelmäßigen Abständen über den aktuellen Stand der Arbeiten informieren. Dabei stehen konkrete Ergebnisse und Antworten auf Fragen, die uns erreichen,
im Vordergrund.

Artenliste (Proben, die uns in der letzten Zeit erreicht haben)

Parosphromenus linkei 1 Tier teilweise sequenziert
Parosphromenus paludicola 1 Tier teilweise sequenziert
Parosphromenus quindecim 2 Tiere teilweise sequenziert
Parosphromenus sp.* 6 Tiere teilweise sequenziert
Betta splendens 3 Tiere DNA isoliert
Betta imbellis 3 Tiere DNA isoliert
Betta sp. 3 Tiere DNA isoliert
Malpulutta kretseri 2 Tiere DNA isoliert
Channa gachua Gewebe eines Tieres DNA isoliert
Channa striata Gewebe eines Tieres DNA isoliert
Channa aurantimaculata 1 Tier DNA isoliert
Parachanna obscura 2 Tiere (juvenil) DNA isoliert
Barbus sp. 2 Tiere DNA isoliert

* hierunter befinden sich Tiere, die unter den Handelsbezeichnungen P. sumatranus, P. anjunganensis, P. bintan-Typ, P. „blue line“ vertrieben wurden, deren Artzugehörigkeit aber unklar bzw. fragwürdig erscheint. Wir erhoffen uns von den genetischen Analysen genaueren Aufschluss.

Ergebnisse

Im Augenblick werden zwei DNA-Fragmente sequenziert. Dabei handelt es sich um die sogenannte 16S rDNA, die oft für Verwandtschaftsanalysen bei Fischen verwendet wird, und um COI, das als DNA Barcode fungieren soll. Beide DNA-Fragmente finden sich in den Mitochondrien (Energieerzeugende Bestandteile der Zelle), die nur mütterlich vererbt werden.
Um eventuellen Hybriden auf die Spur zu kommen, werden wir in einem zweiten Schritt auch Gene aus dem Zellkern sequenzieren.
Wir gehen davon aus, dass wir im Januar alle Sequenzen der oben aufgeführten Tiere fertig gestellt haben.

Hinweise

Im Februar 2006 erscheint die neue Ausgabe der Zeitschrift „Biologie in unserer Zeit“, in der wir einen Artikel zum Thema „DNA Barcoding“ verfasst haben. Wer sich für die Idee des DNA-Barcoding mehr interessiert, der kann unter den folgenden Links einen Einblick in die aktuellen Projekte bekommen.

http://www.fishbol.org (Die globale Initiative zur Erfassung aller Fischarten mittels DNA Barcoding)

http://www.lepbarcoding.org (Ein Projekt zur Erfassung von Schmetterlingsarten)

http://www.barcodinglife.com (Webpage des Barcoding of Life Centers in Guelph, Kanada)

http://barcoding.si.edu (Offizielle Webpage der Barcoding of Life Initative)

http://www.bolnet.ca (Die kanadischen Aktivitäten (zur Zeit die einzige Nation, die national organisiert ist)

Danksagungen

Unser besonderer Dank für Bereitstellung von Proben und zahlreiche Informationen gilt Philipp Dickmann, Peter Finke, Karen Koomans, Christian Kanele, Horst Linke, Norbert Neugebauer und Kai Witte.

Wir hoffen, Ihnen auf diesem Wege ein paar interessante Neuigkeiten vermittelt zu haben. Sobald sich bei uns wieder etwas Neues tut, werden wir einen neuen Newsletter auf die Reise schicken.

Einstweilen wünschen wir allen ein geruhsames Weihnachtsfest und ein schönes neues Jahr!

Dirk Steinke (Universität Konstanz)

Prof. Dr. Peter Finke (Universität Bielefeld, Moderator Prachtguramis)